{"id":13050,"date":"2020-04-08T06:05:44","date_gmt":"2020-04-08T09:05:44","guid":{"rendered":"http:\/\/noticiasdelgolfo.com.ar\/?p=13050"},"modified":"2020-04-08T07:02:02","modified_gmt":"2020-04-08T10:02:02","slug":"covid-19-cientificos-lograron-secuenciar-3-genomas-del-coronavirus-en-argentina","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/noticiasdg.com.ar\/?p=13050","title":{"rendered":"COVID-19: Cient\u00edficos lograron secuenciar 3 genomas del coronavirus en Argentina"},"content":{"rendered":"\n

Se realiz\u00f3 en el Instituto Malbr\u00e1n. Uno pertenece a China, uno a Europa y otro a Estados Unidos. Servir\u00e1 para seguir la evoluci\u00f3n de la enfermedad y realizar mapas de vigilancia y pron\u00f3sticos a futuro<\/h3>\n\n\n\n

El coronavirus <\/a>que infect\u00f3 a m\u00e1s de 1,3 millones de personas en todo el mundo y ya mat\u00f3 a casi 80.000<\/strong> personas no es exactamente el mismo<\/strong> que el que se contagiaron los m\u00e1s de 377.000 estadounidenses, los 130.000 italianos o los 1.628 argentinos al d\u00eda de hoy. A medida que este se va propagando y pasa de un hu\u00e9sped a otro, sufre mutaciones.<\/p>\n\n\n\n

\"El
El SARS-CoV-2 es observado en un microscopio electr\u00f3nico en un laboratorio de EEUU – REUTERS<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Esto fue comprobado hace varias semanas por distintos laboratorios alrededor del mundo que pudieron secuenciar el virus que est\u00e1 presente en sus pa\u00edses o ciudades. Y este vital logro lleg\u00f3 a la Argentina, donde se conoci\u00f3 que nuestro pa\u00eds ha logrado secuenciar 3 genomas del virus SARS-CoV-2<\/strong>, que originalmente apareci\u00f3 en noviembre de 2019<\/strong> en un mercado de animales vivos y muertos en Wuhan, China.<\/p>\n\n\n\n

\"En<\/a>
En el mapa se puede observar claramente de d\u00f3nde provienen los 3 genomas secuenciados. Uno pertenece a China, uno a Europa y otro a Estados Unidos. (Nextstrain)<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

La secuenciaci\u00f3n del genoma del nuevo coronavirus la realizaron los cient\u00edficos del Departamento de Virolog\u00eda <\/strong>del Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas de la ANLIS (Administraci\u00f3n Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud) Malbr\u00e1n<\/strong>, quienes pudieron comparar sus estudios con el genoma identificado por cient\u00edficos chinos el 14 de enero y por los que se aislaron en muchos otros pa\u00edses en las \u00faltimas semanas.<\/p>\n\n\n\n

Como el genoma del virus est\u00e1 en continua mutaci\u00f3n, eso es justamente lo que les permite seguir su trayectoria en los diferentes pa\u00edses y rutas de transmisi\u00f3n.<\/p>\n\n\n\n

El organismo tiene la capacidad de hacer la vigilancia del virus, <\/strong>es decir, el rastreo nacional de su esparcimiento y la capacidad para procesar las muestras de casos sospechosos que se vayan remitiendo a la instituci\u00f3n, con el objetivo de \u201cdescartar si es influenza y, en el caso de que no lo sea, proseguir con el procedimiento para desestimar que no se trate de alg\u00fan otro coronavirus.<\/p>\n\n\n\n

\"La<\/a>
La enfermedad COVID-19 se ha esparcido en todo el mundo a una velocidad muy r\u00e1pida – REUTERS\/Thomas Peter\/File Photo<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

La plataforma Nextstrain, <\/strong><\/a>un sitio cient\u00edfico colaborativo de c\u00f3digo abierto<\/strong> para todos los laboratorios y personas del mundo, ha elaborado un mapa con todos los secuenciamientos gen\u00e9ticos del nuevo coronavirus realizado hasta ahora, y en donde se observa que tres genomas de \u00e9ste fueron identificados en Argentina como los circulantes.<\/p>\n\n\n\n

El cient\u00edfico Mart\u00edn V\u00e1zquez, <\/strong>bi\u00f3logo molecular e investigador del Conicet, explic\u00f3 a Infobae <\/strong>la importancia de esta secuenciaci\u00f3n local.<\/p>\n\n\n\n

\u201cSe trata de un gran logro de los investigadores del Instituto Malbr\u00e1n,<\/strong> que desde hace varias semanas vienen trabajando con la secuenciaci\u00f3n original china y la informaci\u00f3n de las muestras del virus circulante en Estados Unidos, Europa y varios pa\u00edses del mundo. <\/strong>En la medida en que sepamos los genomas que est\u00e1n circulando en Argentina, m\u00e1s nos podemos anticipar a las medidas necesarias para abordar este problema\u201d, precis\u00f3 V\u00e1zquez.<\/p>\n\n\n\n

El investigador indic\u00f3 que el genoma de un virus es de ARN<\/strong>. Y que cuando se realiza un hisopado a una persona a trav\u00e9s de la t\u00e9cnica llamada PCR, la misma no lee la secuencia total del virus. Solamente detecta si lo ve o no.<\/strong> En cambio, la secuenciaci\u00f3n permite leerlo y por ello detectar el virus y su genoma.<\/p>\n\n\n\n

\"Cientificos<\/a>
Cientificos de la Universidad de Tsinghua en Beijing, China, analizan la secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica del SARS-CoV-2 – REUTERS\/Thomas Peter\/File Photo<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

\u201cUna secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica nos sirve para hacer la vigilancia del virus. <\/strong>Si \u00e9ste muta y c\u00f3mo. Los virus van cambiando algunas letras de su genoma a medida que se esparcen y multiplican. Son errores que se producen al azar al reproducirse. Con la t\u00e9cnica de la secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica, se puede hace la genealog\u00eda del virus y seguir sus mutaciones.<\/strong> A ese proceso se lo llama filogenia molecular\u201d, afirm\u00f3 el especialista.<\/p>\n\n\n\n

Y agreg\u00f3: \u201cEn este mapa donde se registraron los 3 genomas argentinos, se pueden identificar uno que ertenece a China, uno a Europa y otro a la parte oeste de EEUU. <\/strong>Con m\u00e1s genomas detectados circulando en el pa\u00eds, se pueden rastrear los or\u00edgenes de cada uno y realizar modelos predictivos y probabil\u00edsticos para anticipar varios problemas, como circulaci\u00f3n del mismo, realizar mapas de movilidad y hacer vigilancia epidemiol\u00f3gica\u201d.<\/p>\n\n\n\n

\"Mapa<\/a>
Mapa de c\u00f3mo evolucion\u00f3 el SARS-CoV-2 en tres meses de propagaci\u00f3n (Nextstrain)<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

El cient\u00edfico, que trabaja hoy en Rosario, donde se encuentra la mayor plataforma de secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica del pa\u00eds<\/strong>, trabaja desde hace varios a\u00f1os en la secuenciaci\u00f3n de genomas de distintas enfermedades en Heritas, una empresa que fund\u00f3 y ahora busca tambi\u00e9n secuenciar genomas del SARS-CoV-2.<\/p>\n\n\n\n

\u201cA fin de mes esperamos obtener los reactivos provenientes de EEUU para comenzar a secuenciar genomas a m\u00e1s escala, lo que nos permitir\u00e1 obtener m\u00e1s informaci\u00f3n de esta enfermedad a nivel nacional y detectar m\u00e1s genomas\u201d, sostuvo el experto.<\/p>\n\n\n\n

En la plataforma internacional donde se exhibe el mapa, explican que \u201cesta filogenia muestra las relaciones evolutivas de los virus del SARS-CoV-2 de la nueva pandemia de coronavirus COVID-19<\/strong> con su aparici\u00f3n inicial en Wuhan, China, en noviembre de 2019, seguida de una transmisi\u00f3n sostenida de persona a persona que conduce a infecciones m\u00faltiples\u201d.<\/p>\n\n\n\n

\"Cient\u00edficos<\/a>
Cient\u00edficos en Lausane, Suiza, analizan la curvatura de contagios en el pa\u00eds helv\u00e9tico – REUTERS\/Denis Balibouse<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Seg\u00fan aclaran, aunque las relaciones gen\u00e9ticas entre los virus muestreados son bastante claras<\/strong>, existe una considerable incertidumbre en torno a las estimaciones de las fechas de transmisi\u00f3n y en la reconstrucci\u00f3n de la propagaci\u00f3n geogr\u00e1fica<\/strong>. Los patrones de transmisi\u00f3n inferidos espec\u00edficos son solo una hip\u00f3tesis que deber\u00e1n confirmarse con m\u00e1s estudios posteriores.<\/p>\n\n\n\n

En el mapa, la numeraci\u00f3n del sitio y la estructura del genoma utilizan Wuhan-Hu-1\/2019 como referencia<\/strong>, donde la filogenia tiene sus ra\u00edces en la ciudad china, en relaci\u00f3n con las primeras muestras detectadas.<\/p>\n\n\n\n

Objetivo del estudio gen\u00f3mico<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Los expertos del Instituto Malbr\u00e1n realizaron el estudio para conocer la din\u00e1mica y diversidad de la poblaci\u00f3n viral de SARS-CoV-2 y las rutas de transmisi\u00f3n en Argentina.<\/p>\n\n\n\n

\"El<\/a>
El laboratorio de Medicina y Virolog\u00eda WU en Seattle, Washington, analiza muestras de COVID-19 – REUTERS\/Brian Snyder\/File Photo<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Despu\u00e9s de tomar las muestras de pacientes argentinos infectados, las mismas fueron fueron derivadas al Laboratorio Nacional de Referencia en el marco de la vigilancia nacional de COVID-19. El resultado fue enviado al Global Initiative on Sharing All Influenza Data<\/strong>, GISAID, entidad que aprob\u00f3 el estudio de forma inmediata.<\/p>\n\n\n\n

GISAID es una iniciativa p\u00fablico-privada, con sede en Alemania<\/strong>, que promueve el intercambio internacional de todas las secuencias del virus de la influenza y datos cl\u00ednicos y epidemiol\u00f3gicos relacionados con virus humanos. Con informaci\u00f3n geogr\u00e1fica y espec\u00edfica busca ayudar a los investigadores a comprender c\u00f3mo evolucionan y se propagan los virus.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

La informaci\u00f3n obtenida a partir de la secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica completa de pacientes argentinos con COVID-19, realizada por el Servicio de Virosis Respiratorias y la Plataforma de Gen\u00f3mica y Bioinform\u00e1tica de INEI-ANLIS<\/strong>, ser\u00e1 \u00fatil para asegurar la calidad del diagn\u00f3stico, complementar la vigilancia epidemiol\u00f3gica y contribuir al desarrollo de una f\u00f3rmula vacunal representativa de las cepas circulantes en nuestro pa\u00eds y la regi\u00f3n.<\/p>\n\n\n\n

Seg\u00fan expertos, poder secuenciar en el pa\u00eds permitir\u00e1 realizar reactivos en la Argentina justo en momentos en que son escasos a nivel mundial debido a la pandemia de coronavirus.<\/p>\n\n\n\n

Por:  V\u00edctor Ingrassia <\/p>\n\n\n\n

_______________________________<\/p>\n\n\n\n

Marina Andr\u00e9s Verdecchia<\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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